التصفية الحيوية أو الاستخلاص الحيوي بالإنجليزية Bioleaching هو عملية استخراج معادن معينة من خاماتها باستخدام الكائنات الحية وتعتبر هذه الطريقة أنظف بكثير من الاستخلاص التكتلي التقليدي باستخدام السيانيد التصفية الحيوية هي إحدى التطبيقات العديدة ضمن معالجة المعادن بالمحاليل تنحصر طرق الاستخراج التقليدية على كثير من الخطوات المكلفة مثل التحميص و